1、巴氏消毒法

這是目前在在水處理設備中使用比較多的消毒方法之一。巴氏消毒主要功能是：

①用于水處理設備的活性炭等預處理單元。

②RO/EDI單元以及儲存與分配管網單元的周期性消毒。

巴氏消毒法也稱低溫消毒法，它的一種能殺死各種病原菌的熱處理方法，其對象主要是病原微生物及其他生長態菌。巴氏消毒的工作原理是，利用病原體不是很耐熱的特點，用適當的溫度和保溫時間處理，將其全部殺滅。但是經過巴氏消毒后，仍保存小部分較耐熱的細菌或細菌芽孢。因此巴氏消毒不是無菌處理過程。

2、過熱水滅菌：

過熱水滅菌簡稱煮沸，是簡單有效的消毒方法，不需要特殊設備即可進行。煮沸時間一般為10～30分鐘。

3、純蒸汽滅菌：

純蒸汽滅菌是一種可靠、經濟、快速滅菌的方法，滅菌后無殘留毒笥。121℃滅菌時間為30分鐘，126℃為20分鐘。

4、紫外線消毒

紫外線消毒在水處理設備中，紫外線消毒裝置主要安裝于水處理設備的RO/EDI循環管路及儲存與分配管網循環管路，以防止系統中微生物指標的過快增長。足夠劑量下，紫外輻射是一種有效的消毒方式。紫外線消毒的原理較為復雜，一般認為它與對生物體內代謝、遺傳、變異等現象起著決定性作用的核酸相關。